Forskere fra MRC-University of Glasgow Center for Virus Research har lanceret Viro3D, verdens mest omfattende database for forudsigelser af proteinstrukturer fra menneske- og dyrevirus. Denne gratis og søgbare database, der er drevet af kunstig intelligens, giver et helt nyt perspektiv på vira og muliggør hurtigere indsigt i deres oprindelse og udvikling. Selvom viruspartikler er de mest udbredte biologiske enheder på jorden, er vores forståelse af dem stadig begrænset. Tidligere forskning har været en langsommelig proces, hvilket har hæmmet udviklingen af behandlinger og vacciner.
Viro3D indeholder høj kvalitets strukturelle modeller for 85.000 proteiner fra 4.400 forskellige virusser, hvilket repræsenterer en 30 gange større videnbase om disse strukturer end tidligere. Håbet er, at databasen vil accelerere forskningen på antivirale lægemidler og vacciner mod nuværende endemiske virusser som hepatitis, HIV, forkølelse og COVID-19 samt skal forberede os på nye pandemiske trusler.
Databasen, som er beskrevet i tidsskriftet Molecular Systems Biology, har allerede afsløret ny information om den genetiske afstamning af SARS-CoV-2, virusset bag COVID-19. Data tyder på, at et nøgleprotein i SARS-CoV-2, ansvarligt for infektion, muligvis stammer fra et genetisk samspil med et forfædre herpesvirus. Forskerne bag Viro3D mener, at databasen kan generere endnu mere viden om virussernes evolutionære historie og oprindelse, hvilket vil forbedre vores forståelse af både menneskelige og dyrevirusser.
Dr. Joe Grove, ledende forfatter ved MRC-University of Glasgow Center for Virus Research, udtaler, at vi kun er i begyndelsen af at forstå den enorme genetiske diversitet inden for virusfællesskabet. Viro3D giver et helt nyt perspektiv og forventes at fremskynde den computerdrevne designprocess for antivirale lægemidler og vacciner, så disse kan bringes fra laboratorierne ud i den virkelige verden. Proteiner er livets byggesten og udfører vitale funktioner for cellerne. For at forstå, hvordan proteiner fungerer, er det nødvendigt at undersøge deres tredimensionelle strukturer. Tidligere har virusproteiner ofte været udelukket fra forudsigelser eller kun blevet inkluderet i begrænsede antal, men Viro3D repræsenterer nu et stort skridt fremad.