Forskere fra University of California, San Francisco, ledet af Martin Kampmann, har udviklet en ny, præcis CRISPR-screeningplatform, der giver mulighed for at undersøge et større antal gener samtidigt direkte i levende mus. Den nye teknik, kaldet CRISPR screening ved AAV episom-sekventering (CrAAVe-seq), blev præsenteret i en artikel offentliggjort i tidsskriftet Nature Neuroscience. Biswa Ramani, en af forfatterne til artiklen, udtaler, at mens cellebaserede systemer er værdifulde, kan de ikke fuldt ud fange hjernens kompleksitet, hvilket gør mus til en effektiv model for mange neurologiske sygdomme.
Projektet har til formål at skabe en platform, der muliggør screening af tusindvis af gener i forskellige hjerneområder samtidigt og i levende dyr. Ramani forklarer, at CRISPR-platformen bruger adeno-associerede vira (AAV) til at levere specifikke sgRNA’er ind i musens intakte hjerne og adskille de resterende AAV-genomer efter et stykke tid. Dette kombineres med genetiske værktøjer til at “fange” og sekventere sgRNA’erne i specifikke celletyper.
Forskerne har formået at studere effekten af at forstyrre tusindvis af gener i millioner af celler i musens hjerne, hvilket gør det muligt at fokusere på specifikke cellepopulationer som neuroner og astrocytter. De rapporterer, at CrAAVe-seq giver mulighed for en høj gennemstrømning af analyse af store gengenom-biblioteker og præcise undersøgelser af specifikke hjerneområder.
Ramani bemærker, at de observerede en robust fremkomst af neuron-essentielle gener fra deres sgRNA-bibliotek, hvilket understreger metoden store potentiale. Det er planen at anvende CrAAVe-seq til at udforske gener under stress, samt på mus modeller af neurologiske sygdomme.
Samlet set kan denne nye CRISPR-platform bane vej for fremtidige studier, der fokuserer på genetiske og neurale processer og hjælper med at afdække specifikke cellulære og molekylære mekanismer bag neurologiske lidelser. Forskningen åbner op for nye muligheder inden for neurovidenskab og kan lede til bedre forståelse af sygdomme som neurodegeneration.